台肥公司與沙烏地阿拉伯的沙特基礎工業公司（SABIC）合資，台肥公司投資新台幣30.5億元，持股比率為50%。朱拜爾肥料公司主要生產尿素、2-EH、DOP等產品，讓台肥公司得以掌握尿素進口貨源，提供生產複合肥料所需的原料。

培豐公司現有一座硝磷基複肥工廠，主要生產添加泥炭之硝磷基「黑旺」複肥產品，以解決國內長期旺季肥料供應吃緊之情形，滿足國內日益增加之肥料轉用需求，並供銷海外市場，培豐公司亦推動化學品貿易及儲運業務。培豐2020年7月建廠完成後，包含硝磷基複肥生產及化學品業務，至今營運穩定且績效良好。

台肥公司百分之百投資之子公司，於花蓮廠區外海佈建首屈一指的先進取水設備，取得深度達662公尺的珍貴純淨深層海洋水，利用海洋深層水具備乾淨無病原菌、富含礦物質、營養鹽與80幾種礦物質及微量元素，精製成高品質包裝飲用水、機能性保健飲料、深海礦物質保健食品、海洋深層水系列保養品，並研發利用海洋深層水發展水產養殖、觀光休閒等應用產業。另配合集團策略發展，業外承接轉投資境外公司於蒙古首都烏蘭巴托市經營「台灣會館」商辦出租業務。

台肥公司百分百投資之子公司，以不動產管理開發業務為主。於基隆、苗栗二處經營加油站業務，並持續配合台肥集團發展不動產的開發利用與管理。

台農發公司致力於為台灣農產品拓展國際市場，透過建立採後處理流程控管品質，和提供專業的運輸服務，打造台灣蔬果優質品牌形象，進而擴大農產品外銷量。

暐世生物科技成立於2005年，在“醫療器材”、“化妝品/護膚品”、“菌種發酵”、“癌症基因鑑定”等領域開發和生產生物醫藥產品。

百泰生技公司成立於 2002 年，致力於農業生物技術，從事生物植保試劑（俗稱生物農藥）和生物肥料的生產，通過百泰擴展的銷售網絡進行銷售。

台安生技公司提供創業投資、投後管理、技術移轉等全面性之投資諮詢與服務。該公司也與全球生技產業資訊接軌，結盟許多國內外合作夥伴，隨時掌握世界生技產業、醫療技術之脈動及生命科學等投資動向。